сквален
Конденсация трех молекул изопентенилпирофосфата приводит к образованию фарнезилпирофосфата. Процесс начинается с изомеризации изопентилпирофосфата (путем перемещения двойной связи) в диметилаллилпирофосфат . Последний конденсируется с другой молекулой изопентенилпирофосфата с образованием десятиуглеродного интермедиата геранилпирофосфата, который затем конденсируется с еще одной молекулой изопентенилпирофосфата; в результате образуется фарнезилпирофосфат . Две молекулы фарнезилпирофосфата конденсируются концами, несущими пирофосфатные группы; сначала отщепляется одна пирофосфатная группа и образуется промежуточное соединение прескваленпирофосфат, которое затем восстанавливается NADPH с элиминированием оставшейся пирофосфатной группы и превращается в сквален.
Следует отметить, что может функционировать побочный путь, который называют " транс-метилглутаконатный щунт ". По этому пути значительная доля (20%) диметилаллилпирофосфата превращается в ГМГ-CoA (через транс-З-метилглутаконат-CoA). По-видимому, данный путь может участвовать в регуляции скорости синтеза холестерола. см. рис. синтез холестерола: метаболическая карта