Транскрипционная пауза: фосфорилирование CTD РНК полимеразы II
Обнаружено, что в регуляцию паузы вовлечена сама РНК полимераза II . Первоначально было замечено, что фосфорилирование карбокситерминального домена ( CTD ) ее большой субъединицы происходит одновременно с переходом к продуктивной элонгации [ O'Brien ea 1994 , Dahmus ea 1996 ], а затем было обнаружено, что для контроля процесса элонгации необходим интактный CTD [ Chun ea 1996 , Marshall ea 1996 ]. Доказательством существования связи между контролем элонгации и фосфорилированием CTD послужило открытие того, что позитивные факторы элонгации транскрипции либо обладают CTD-киназной активностью, т.е. способны сами фосфорилировать CTD РНК-полимеразы II[ Marshall ea 1996 , Marshall ea 1995 ], либо активируют CTD-киназы , связываясь с ними [ Cujec ea 1997 ]. Эту связь подтверждают данные, что ингибирование активности Сdc2-связанной протеинкиназы, названной PITALRE и ответственной за позитивную транскрипцию с помощью фактора P-TEFb , ингибирует фосфорилирование CTD РНК-полимеразы II и блокирует тем самым переход инициаторного комплекса в элонгаторный [ Mancero ea 1997 , Zhu ea 1997 ]. Следует отметить, что в неиндуцированном гене hsp70 у дрозофилы CTD домен РНК-полимеразы II нефосфорилирован [ Weeks ea 1993 ], тогда как в активном гене он гиперфосфорилирован [ O'Brien ea 1994 , Laybourn ea 1990 ]. Полагают, что в формирование паузы вовлечены ТАТА-связывающие белки TFIID , которые, как показано, способны взаимодействовать только с нефосфорилированной формой CTD РНК-полимеразы II [ Usheva ea 1992 ]. Эту связь, по-видимому, и нарушает фосфорилирование.