Нуклеосомы: определение положения на ДНК
Гистоновые октамеры обычно не передвигаются по ДНК, а остаются закрепленными в одном положении. Следующие факторы определяют, где на ДНК формируются нуклеосомы:
1. Необходимость сгибания двойной спирали ДНК вокруг наружной стороны гистонового октамера приводит к тому, что гистоновый октамер будет стремиться расположить себя на ДНК так, чтобы максимизировать А-Т-богатые малые бороздки ДНК на внутренней (по отношению к октамеру) стороне двойной спирали ДНК. Таким образом, сегмент ДНК, содержащий короткие А-Т-богатые последовательности (которые легче сжимаются, чем G-C-богатые) и разделенные целыми числами оборотов ДНК, сможет согнуться вокруг гистонового октамера с большей легкостью, нежели сегмент ДНК, не обладающей такой чертой.
2. Присутствие других плотно связанных белков на ДНК может предотвращать формирование нуклеосом. Такие участки часто находятся в регуляторных районах генов и по способу детекции называются нуклеазо- гиперчувствительными сайтами .
Большинство свободных от нуклеосом районов специфически создается в процессе активации транскрипции ДНК белками-регуляторами генов.