Матрикс ядерный - ДНК связывающие белки
Очень мало известно о той структуре, с которой взаимодействует MAR . MAR куриного лизоцима взаимодействует с ядерным матриксом клеток куриного яйцевода так же специфично, как и MARs мыши или дрозофиллы ( Cockerill P.N. ea, 1987 , Cockerill P.N. and Garrard W.T., 1986 ). Так же MARs мыши специфически взаимодействуют с дрожжевыми ядерными матриксами ( Cockerill P.N. ea, 1987 , Cockerill P.N. and Garrard W.T., 1986 ). Вероятно, основной механизм взаимодействия ДНК с ядерным матриксом эволюционно консервативен.
Топоизомераза-2 , присутствующая в ядерном матриксе в большом количестве, вряд ли может выполнять функцию связывания хроматина, так как эти взаимодействия сохраняются в ядрах, ее лишенных ( Phi-Van and Stratling W.H., 1988 ). Возможно, что узнавание последовательностей топоизомеразой-2 основано на том, что торсионное напряжение молекулы ДНК в основаниях петлевых доменов является сигналом, распознающимся ферментом.
Для F/G матрина показано связывание с ДНК, возможно через домены цинковых пальцев ( Hakes D.J. and Berezney R., 1991 ). Для ламина А и ламина С (но не В), матрина D и матрина Е так же было показано специфическое взаимодействие с ДНК, преимущественно в одноцепочечной форме, причем предпочтительно связывались участки ямДНК . Исследования связывания ядерного матрикса с ДНК показали, что внутренние белки матрикса ( матрины D , E , F , G и 4 ) в комплексе с ламинами А и С могут связывать ДНК и, таким образом, сайты взаимодействия нуклеоскелета с хроматином могут присутствовать как внутри ядра, так и на его периферии ( Hakes D.J. and Berezney R., 1991 ).
В других исследованиях имелись данные о том, что ДНК- связывающий белок SATB1 может связывать ДНК MARs через узнавание сахарофосфатного остова АТС-последовательности ( Dickinson L.A. ea, 1992 ).
В исследованиях по связыванию с матриксом, выделенным из печени крысы, MAR из гистонового кластера дрозофиллы, были идентифицированы белки, связывающие ДНК . Был найден матриксный протеин 67 кДа - ламин В1 и минорный ламин В2 . Возможно, что в некоторых клетках ключевую роль в связывании ДНК через MAR-элементы играет В-ламин , так же как в других - ламин А и ламин С ( Luderus M.E.E. ea, 1992 ).
