p53 белок: Структура четвертичная
Функциональные активности показаны как для мономерного р53 ( Tarunina et al., 1993 , Friedman et al., 1993 ) так и для димера ( Hupp et al., 1992 ) и для тетрамера р53 ( Stenger et al., 1994 , Hainaut et al., 1994 ). Все обнаруженные в генах р53-связывающие последовательности ДНК, удовлетворяющие каноническому консенсусу ( El-Diery et al., 1992 ) состоят из двух смежных симметричных между собой полусайтов по 10 п.н., имеющих внутреннюю инвертированную симметрию 5 п.н.
Такая организация белок-связывающей последовательности предполагает симметричное взаимодействие двух мономеров р53 с каждым 10 п.н.-полусайтом и, следовательно, тетрамера р53 с полной последовательностью консенсуса ( El-Diery et al., 1992 ).
Четвертичная структура функционально активного WT р53 в клетке по-видимому представляет собой тетрамер и/или димер. "Тетрамерная" модель белка р53 согласуется со структурой комплекса белковых фрагментов (319-360 а.о.), содержащих олигомеризационный домен р53, которая была определена методом многомерного ЯМР-анализа ( Clore et al., 1994 ). Данный комплекс представлял собой 20kD альфа-симметричный тетрамер с топологией типa: "димер димеров". Каждый мономер в комплексе представлен одной бета-цепью (326-334 а.о.) и одной альфа-спиралью (337-355 а.о.). Каждый из двух первичных димеров включает две антипараллельные альфа-спирали, связанные антипараллельным бета- слоем. Первичные димеры стабильны благодаря прежде всего бета- слою, а также взаимодействию спиралей. Взаимосвязь между двумя димерами, образующими тетрамер, опосредована только контактами между спиралями. Общим результатом сборки является симметричный 4-спиральный узел, в котором соседние спирали ориентированы антипараллельно между собой и 2 антипараллельных бета-слоя расположены на противоположных сторонах тетрамера. Структура тетрамера стабилизируется не только гидрофобными взаимодействиями белкового кора, но и рядом электростатических взаимодействий: водородных связей и солевых мостиков ( Clore et al., 1994 ).
Из структуры комплекса видно, что ДНК-связывающие домены субьединиц одного первичного димера расположены на 10-12 ангстрем ближе друг к другу, чем к ДНК-связывающим доменам другого димера, что согласуется с наличием 2-х 10 п.н.- палиндромов в типичном сайте связывания р53 и предполагает попарное связывание димеров в составе тетрамерного комплекса с соседними полусайтами консенсуса.
