Рис 3 fed
Рис 3. Узнавание промоторной последовательности.
Первоначальное
связывание РНК-полимеразы осуществлятся через взаимодействие
поверхности
на РНК-полимеразе, имеющей форму канала с "-35 нп " гекзамером
ДНК,
приводя к образованию закрытого комплекса (closed complex). Затем эта
стадия переходит в промежуточный комплекс (intermediate), вовлекая
ближайший участок ДНК во взаимодействие и вызывая выравнивание "-10
нп"
бокса в соответствии с "-35 нп" боксом. Такое скручивание
вызывает
напряжение в ДНК, что облегчает переход в открытый комплекс
(open
complex), одновременно приводя к значительному увеличению изгиба в
этой
части ДНК.