Роль SWI/SNF-подобных белков ремоделинга хроматина
Данные о том, что для обеспечения соответствующего метилирования необходимы также вспомогательные факторы хроматина, первоначально были получены на растениях, где было показано, что для полного метилирования генома A. thaliana существенное значение имеет SNF2-пoдoбный белок DDM1 ( Jeddeloh et al., 1999 ). Аналогичная зависимость наблюдается и у животных, поскольку мутации в генах ATRX человека ( Gibbons et al., 2000 ) и Lsh2 мыши ( Dennis et al., 2001 ), которые оба кодируют белки, родственные белку ремоделинга хроматина, SNF2 , существенно влияют на паттерны глобального метилирования ДНК. В частности, утрата белка LSH2 соответствует фенотипу мутации DDM1 у Arabidopsis , поскольку оба мутанта утрачивают метилирование высокоповторяющихся последовательностей ДНК, но сохраняют некоторое метилирование в других местах генома. Возможно, эффективное глобальное метилирование генома требует изменений структуры хроматина этими ремоделирующими хроматин белками, чтобы DNMTs могли получить доступ к ДНК. "Сотрудничество" между DNMTs и факторами хроматина, позволяющее им получить доступ к специализированным участкам хромосом, может иметь особенно важное значение в районах, являющихся "гетерохроматиновыми" и недоступными.
