Табл. 8.1(epig). Консерватизм RNAi и белков гетерохроматина

S. pombe

A. thaliana

С. elegans

Drosophila

H. sapiens

Dcr1

DCL1 - 4

Dcr-1

Dcr1 и 2

DCR-1

Ago1

AGO1-10

Rde-1, Alg-1 и -2

Ago1 - 3, Piwi

AGO-1 - ACO-4

 

PRC-1 и 2, и 19 других

Aubergine/Sting

Piwi-1-Piwi-4

PIWI-1-PIWI-4

Chpl*

СМТЗ

 -

 -

 -

Tas3** 

 -

 -

 -

 -

Rdp1

RDR1 - 6

Ego-1, Rrf-1 - 3

 -

 -

Hrr1

SGS2/SDE3

ZK1067.2

GH20028p

KIAA1404

Cidl2

***

Rde-3, Trf-4***

CG11265

POLS***

Swi6

LHP1 (TFL2)

Hpl-1, Hpl-2, F32E10.6

HP1

HP1 alfa,beta,gamma

Clr4

SUVH2-6

****

Su(var)3-9

SUV39H1 и 2

Rikl*****

DDB1

M18.5

Ddb1

DDB1

Cul4

CUL4

Cul4

Cul4

CUL4

Sir2

SIR2

Sir2-1

Sir2

SIRT1

Eri1

ERI1

Eri-1

CG6393

THEX1

 

 

 

 

 

 

 

 

 

(*) Очевидный ортолог хромодоменного белка, Chp1, не был идентифицирован у других модельных организмов, 

перечисленных  здесь, но большинство   эукариотических клеток содержит множественные хромодоменные белки. 

СMTЗ у Arabidopsis является хромодоменной ДНК-метилтрансферазой, которая работает в том же пути, что и AG04, 

и может быть аналогичной Chp1.

(**) Никакие очевидные ортологи Tas3 не были идентифицированы, но имеет место слабое сходство по 

аминокислотной последовательности с белком, специфичным для яичника и семенника мыши (NP_035152). 

(***) Cidl2 относится к большому семейству консервативных белков, имеющих сходство по аминокислотной 

последовательности с классической поли(А)полимеразой, а также с 2'-5'-олигоаденилатными энзимами.

(****) С. elegans обладает примерно 20 доменными белками SET, но НЗК9 НКМТ не была еще идентифицирована 

у этого организма.

(*****) S. pombe содержит другой Rik1-подобный белок, Ddb1, который участвует в репарации повреждений ДНК, 

но неизвестно, участвует ли он и в формировании гетерохроматина.

Ссылки: