Терминация транскрипции Pol I: механизм
У мышей терминация транскрипции рДНК происходит на 565 п.о. ниже кодирующей части гена 28S РНК . 3'-Конец терминирующего транскрипта картирован за 21 п.о. перед 18-нуклеотидным повтором, названным Sal-боксом (AGGTCGACCAGA/TT/ANTCCG) , который входит в состав терминатора транскрипции. Десять таких повторов, фланкированных протяженными кластерами пиримидиновых оснований, локализованы в нетранскрибируемых спейсерах рДНК.
У человека длина повтора составляет 11 п.о. (GGGTCGACCAG), и его последовательность соответствует таковой 5'-концевой части мышиного повтора. Последовательности, фланкирующие повторы, оказывают влияние на точность и эффективность терминации транскрипции, а функционирование всего терминатора зависит от его ориентации на ДНК. С помощью мутационного анализа и футпринтинга установлено, что фактор терминации транскрипции TTF-I взаимодействует с Sal-боксом и останавливает элонгирующую РНК-полимеразу I (Pol I) .
Связываясь с последовательностями терминаторов, TTF-I изгибает молекулу ДНК и вызывает задержку элонгирующего транскрипционного комплекса на терминаторе. Предполагается, что в этот момент происходит конформационное изменение молекулы Pol I, что ослабляет взаимодействие компонентов комплекса друг с другом (как это имеет место в случае РНК-полимеразы E.coli на p- независимых терминаторах транскрипции).
Окончательный распад комплекса и освобождение Pol I и синтезированной молекулы РНК происходит в присутствии фактора PTRF (polymerase and transcript release factor) , который контактирует как с Pol I, так и с TTF-I.
