Сплайсосома: анализ посредством футпринтинга
Образование функционального комплекса сплайсинга включает взаимодействие факторов сплайсинга со специфическими участками пре-мРНК. Изучение с помощью футпринтинга показывает, что при in vitro сплайсинге еще до разрезания пре- мРНК белки специфически связываются как и с брэнч сайтом так и с 5' сайтом сплайсинга . Связывание белков с брэнч сайтом лариата РНК обьясняет устойчивость этого вида РНК к нуклезам, обладающими способностью к разрыву брэнч сайта ( Ruskin B. 1986 ).
C помощью футпринтинга доказано in vitro взаимодействие U1 мяРНП и 5' сайта сплайсинга; U2 мяРНП и брэнч сайта и взаимодействие мяРНП с 3' сайтом сплайсинга; взаимодействие U5 ( Chabot B. 1985 , Black D.L. 1985 ).
