Smug1 ген человека
Smug1 ген расположен на хромосоме 12 в районе 12q13.11-q13.3 [ Haushalter, ea 1999 ]. В состав гена входят 4 экзонa; синтезируется единственная изоформа мРНК и белка. Экспрессия гена smug1 активируется фактором транскрипции NFI/CTF [ Elateri, ea 2003 ]. Белок hSMUG1 представляет собой полипептид длиной 270а.к.о. с расчетной ММ 29862Да.
Белки SMUG1 составляют отдельную группу урацил-ДНК-гликозилаз ( урацил-ДНК-гликозилазы семейства 3 ). Гомология их последовательности урацил-ДНК-гликозилазам из других семейств достаточно низка и в основном ограничена остатками, образующими активный центр фермента [ Wibley, ea 2003 ]. Однако в пространственной структуре SMUG1 из X.laevis [240] сохраняется как общая укладка полипептидной цепи, характерная для других урацил-ДНК- гликозилаз, так и механизм выворачивания поврежденного звена из цепи ДНК. Субстратная специфичность SMUG1 шире, чем у других урацил-ДНК- гликозилаз, и он может служить достаточно эффективным вспомогательным ферментом для репарации пар Ura:Gua или Ura в одноцепочечной ДНК [ Kavli, ea 2002 , Nilsen, ea 2001 ]. SMUG1 способен функционально компенсировать недостаток UNG в штаммах дрожжей ung, а в клетках мышей ung-/- представляет собой основную урацил-ДНК-гликозилазную активность [219].
Выяснилось, что белку SMUG1 принадлежит 5-hmUra-ДНК- гликозилазная активность [ Kavli, ea 2002 ]. Помимо этого, SMUG1 выщепляет из ДНК eCyt [ Kavli, ea 2002 ], fUra и 5-гидроксиурацил [ Masaoka, ea 2003 ]. Структурные исследования и сайт- направленный мутагенез выявили интересный механизм, основанный на связывании и высвобождении молекулы воды, благодаря которому SMUG1 может выщеплять все эти основания из ДНК, не затрагивая в то же время неповрежденные или другие окисленные пиримидиновые основания [ Wibley, ea 2003 ]. Фермент стимулируется физиологическими концентрациями Mg2+ [ Kavli, ea 2002 ].
