SMUG1 (оцДНК-специфическая урацил-ДНК-гликозилаза
Этот класс ферментов с урацил-ДНК-гликозилазной активностью был обнаружен скринингом транслированной in vitro экспрессионной библиотеки Xenopus laevis с использованием ОДН-лигандов, содержащих пирролидиновые аналоги переходного состояния ДНК-гликозилаз (разд. ДНК-гликозилазы: каталитический механизм ) [ Haushalter, ea 1999 ]. Клонирование гена X.laevis позволило обнаружить в базах данных соответствующие последовательности и из других видов хордовых (в том числе человека) и членистоногих [219]. Поскольку высокоочищенные препараты фермента лучше расщепляют одноцепочечную ДНК, чем двуцепочечную, он получил название SMUG1 (single-stranded-specific monofunctional uracul-DNA glycosylase 1). Однако исследование фермента SMUG1 методом одного оборота показывает, что на самом деле его основной субстрат - это двуцепочечная ДНК, для которой значение kcat выше в ~700 раз, чем для одноцепочечной [ Wibley, ea 2003 ]. Кажущаяся низкая активность SMUG1 по отношению к двуцепочечной ДНК вызвана сильным ингибированием двуцепочечным ДНК-продуктом, содержащим AP-сайт ; число оборотов фермента значительно возрастает в присутствии AP-эндонуклеаз, которые, по всей вероятности, вытесняют SMUG1 из комплекса с продуктом [ Kavli, ea 2002 , Nilsen, ea 2001 ]. См. Smug1 ген
