Hox-3.1 ген
Ген мыши Hox-3.1 относится к кластеру HOX-3 15-й хромосомы . В процессе эмбриогенеза транскрипт Hox-3.1 обнаруживается вначале в задней части нервной трубки 9,5-дневного эмбриона. На более поздних стадиях развития устанавливается вентрально-дорзальный градиент аккумуляции транскрипта Hox-3.1. Hox-3.1 обнаруживается также в грудных склеротомах с 6-го по 10-й грудные позвонки.
Вероятно, для установления сложного пространственно-временного паттерна экспрессии гена Hox-3.1 необходимы cis-регуляторные области, содержащие множество последовательностей-мишеней различных транскрипционных факторов.
Установлено, что промоторные элементы Hox-3.1, необходимые для установления правильного паттерна экспрессии на ранних этапах развития эмбриона, отличаются от тех, которые необходимы на поздних. Возможно, элементы, расположенные дальше от кодирующей области Hox-3.1 необходимы для возникновения соответствующего уровня паттерна экспрессии. Подобный регуля- торный элемент в пределах локуса HOX-3 может действовать отдельно или совместно с более проксимальными элементами для влияния на экспрессию Hox-3.1 и, возможно, других генов кластера.
В области транскрипции Hox-3.1 и в области между генами Hox-3.2-3.2 присутствуют несколько потенциальных последовательностей взаимодействия с гомеодоменом и белками с цинковыми пальцами, включающих полное соответствие консенсусным последовательностям, узнаваемым белком Hox-1.3. Были также обнаружены несколько GC - боксов , представляющие собою потенциальные сайты связывания транскрипционного фактора Sp1. Любопытно, G+C-богатый домен с несколькими сайтами связывания Sp1 был обнаружен в upstream-области сайта инициации транскрипции гена Hox-1.4 gene ; аналогичный участок расположен в upstream-области сайта инициации трансляции гена Hox-3.1. Были идентифицированы мотивы последовательностей, напоминающие области узнавания гормонов, включая область узнавания глюкокортикоидов(GRE) , расположенную upstream по отношению к сайту инициации транскрипции, а также область узнавания тиреоидных гормонов (TRE) в интроне. TRE-подобные последовательности, содержащие спейсер длиной 7 н.п., присутствуют на расстоянии 220 н.п. upstream от сайта старта транскрипции. Такие TRE-подобные последовательности могут опосредовать реакцию на морфоген ретиноевую кислоту . В связи с этим важно отметить, что экспрессия гена Hox-1.3 индуцируется РК в клетках эмбриональной карциномы F9. В дополнение к этому, в 5'-области были обнаружены мотивы последовательности, обладающие гомологией с областями узнавания эстрогенов . Другая область, участвующая в регуляции экспрессии генов в процессе развития - область узнавания белков теплового шока (HSE) . Кроме того, анализ последовательности показал наличие нескольких повторяющихся нуклеотидных мотивов, некоторые из которых могут быть вовлечены в образование изменённой структуры хроматина и/или связывание регуляторных белков (сайты, подобные областям узнавания Antp, Kr, ftz, en/eve). Энхансер SV40 ). Были идентифицированы два обширных CT- повтора, проксимальный и дистальный, последовательность (GT)22, последовательность (T)26 и повтор GATA.
