Окраска флюорохромами
Окраску флюорохромами, например акридиновым оранжевым, применяют для выявления лейкоцитов , дрожжевых грибов и бактерий в биологических жидкостях.
Специальные методы окраски ДНК флюорохромами (например, DAPI - 4,6-диамидино-2-фенилиндолом) используют для обнаружения Mycoplasma spp. в культуре клеток.
Для идентификации микроорганизмов по морфологическим особенностям окрашивают их капсулы, жгутики, споры.