Genomic SELEX
Для поиска сайтов связывания различных белков с геномными последовательностями ДНК и РНК (например, в случае факторов транскрипции, сплайсинга, регуляторов трансляции) используют библиотеки на основе геномных последовательностей - genomic SELEX ( Gold et al., 1997a ; Shtatland et al., 2000 ). Для создания таких библиотек геномную ДНК фрагментируют на достаточно короткие участки (50- 500 нт.) и присоединяют к ним участки фиксированной последовательности. При анализе последовательностей РНК в один из фиксированных участков вносят последовательность Т7-промотора. Дальнейший отбор последовательностей, связывающихся с белком-мишенью, проводят стандартными методами.
