Механизмы стабилизации промоторного комплекса: общие сведения
Эффективность инициации транскрипции зависит от стабильности промоторного комплекса, изменение которой может быть одним из важных механизмов регуляции транскрипции ( Gourse et al., 1998 ; Gross et al., 1998 ). Установлены зависимость стабильности промоторных комплексов РНКП от последовательности промотора и увеличение стабильности от наличия консенсусных промоторных элементов (-10, -35, TG и UP) ( Gourse et al., 1998 ; McClure, 1985 ). Однако, влияние других участков промотора на стабильность промоторного комплекса исследовано не было. Функции различных структурных элементов РНКП в стабилизации промоторных комплексов также изучены слабо. Было показано, что на стабильность промоторных комплексов влияют мутации в сигма-субъединице ( Fenton et al., 2000 ; Gross et al., 1998 ; Vuthoori et al., 2001 ), а также в кор-ферменте РНКП E. coli ( Ederth et al., 2002 ; Nechaev et al., 2000 ). Таким образом, стабильность промоторных комплексов, по-видимому, определяется как специфическими, так и неспецифическими контактами РНКП с промоторной ДНК.
РНКП разных бактерий могут значительно различаться по стабильности промоторных комплексов. Так, РНКП E. coli образует на большинстве промоторов очень стабильные комплексы (время полужизни до нескольких часов) ( McClure, 1985 ). РНКП B. subtilis и Rickettsia prowazekii , напротив, образуют нестабильные комплексы ( Aniskovitch and Winkler, 1995 ; Artsimovitch et al., 2000 ). Молекулярные механизмы, лежащие в основе данных различий, оставались неизвестны.
