Метилирование CpG-островков в геноме опухлевых клеток
Аберрантное метилирование CpG-островков в опухоли - крупномасштабный феномен. Подавляющее число исследований метилирования CpG-островков в опухоли имело своей целью конкретные гены. В последнее время, однако, появилась возможность методом рестрикционно-ориентированного геномного сканирования ( RLGS ) анализировать одновременно статус метилирования тысяч CpG-островков. Таким способом были сопоставлены примерно 1200 CpG-островков в 98 опухолях человека разного происхождения и в соответствующей нормальной ткани [ Lisitsyn, ea 1993 ]. Такой "взгляд с птичьего полета" на глобальное метилирование генома нормальных и опухолевых клеток позволил прийти к важным выводам. Установлено, в частности, что метилирование CpG-островков проявляет, с одной стороны, определенную опухолевую специфичность (т.е. существуют сайты, метилированные во многих опухолях разной локализации и неметилированные в норме) и, с другой стороны, некоторую специфичность по отношению к разным видам опухолей (т.е. некоторые сайты метилированы в одних опухолях и неметилированы в других). Приблизительные расчеты показывают, что среднее число CpG-островков, гиперметилированньгх в геноме опухолевой клетки, составляет примерно 600 (от 0 до 4500) из общего их числа в геноме человека (примерно 45 000) и, следовательно, примерно таким же должно быть число аберрантно ингибированных в опухолевой клетке генов. Тот факт, что особой разницы в степени метилирования CpG-островков в зависимости от стадии опухолевого процесса не выявлено, свидетельствует о том, что соответствующие сдвиги появились на раннем этапе развития опухоли. Масштаб выявленных изменений позволяет предположить существование большого числа генов помимо уже установленных, критически важных для роста опухоли и ее прогрессии. Выявление CpG-островков, гиперметилированных в опухолях, есть первый шаг к идентификации близко расположенных генов, большинство из которых пока не установлено. MCA метод
