Субъединица II (интегральный белок II) комплекса III
Методами генной инженерии установлены структурные гены с-DNA, кодирующие интегральные белки - субъединицу I [ TzagoloffA., ea 1986 ] и субъединицу II [ Oudshorn ea 1987 ] комплекса III дрожжевых митохондрий. Определена последовательность субъединицы II дрожжевого комплекса III, белок содержит 352 аминокислоты с Mr = 38.714 Да [ Oudshorn ea 1987 ]. Субъединица II, как и большинство белков митохондрий, синтезируемых в цитоплазме, образуется в виде предшественника с N-терминальной последовательностью из 16 остатков аминокислот, необходимой для транспорта белков в митохондрии . Дрожжевые мутанты, лишенные субъединицы II, имели сниженную активность III комплекса и резко уменьшенное содержание других субъединиц комплекса, особенно цитохрома b [ Oudshorn ea 1987 , Schoppink ea 1989 ]. Отсюда можно заключить, что субъединица II участвует в сборке комплекса.
Первичная структура субъединиц I и II свидетельствует об их значительной гидрофильности и отсутствии гидрофобного участка достаточной длины для пересечения мембраны [ Weiss ea 1990 ]. По-видимому, обе субъединицы являются периферическими мембранными белками, вопреки их названию. Это подтверждается и легкостью перехода I и II субъединиц в водорастворимую фракцию при обработке комплекса III детергентами [ Oudshorn ea 1987 , Weiss ea 1990 ]. Однако, по данным некоторых других авторов, эти субъединицы являются трансмембранными. К этому вопросу мы вернемся при обсуждении топологии III комплекса в мембране.