Ретровирусы как транспозоны
Ретровирусы - это РНК-содержащие вирусы, по своей структуре сходные с транспозонами . Хотя они наиболее сложные среди всех ретроэлементов, стоит обсудить их первыми, поскольку концепция ретропозиции возникла после открытия жизненного цикла ретровирусов. После того, как ретровирус, называемый на этой стадии вирионом, проникает в клетку-хозяина, с его РНК с помощью обратной транскриптазы синтезируется ДНК-копия. Эта ДНК может интегрировать в геном клетки и стать провирусом. Далее, с ДНК провируса считываются последовательности РНК, которые могут служить в качестве матрицы для синтеза вирусных белков и в качестве вирусных геномов, которые могут быть упакованы в новые вирионы. Когда формируются вирионные частицы, цикл начинается снова.
Ретровирусы имеют по крайней мере три гена: gag, pol и env. Эти гены соответственно кодируют: некоторые внутренние белки, ферменты (включая обратную транскриптазу) и белок оболочки. Многие ретровирусы обладают дополнительными генами, например, ВИЧ (вирус иммунодефицита человека) имеет по меньшей мере шесть таких генов. Кодирующий участок ретровирусов фланкирован длинными краевыми повторами (LTR), в которых содержатся промоторы транскрипции (на стадии провируса) и обратной транскрипции (на вирионной стадии).
