Эволюция процессированных псевдогенов
Как уже упоминалось в других разделах ( см. 8.5 ), лишь только процессированный псевдоген возникает в качестве геномной последовательности, он уже нефункционален и свободен от селективных ограничений. Поскольку псевдоген потерял функцию, на него влияют два эволюционных процесса ( Graur et al, 1989b ). Первый включает в себя быстрое накопление точечных мутаций и неизбежно стирает сходство последовательностей псевдогена и его функционального гомолога, который эволюционирует гораздо медленнее. Нуклеотидный состав псевдогена будет становиться все более и более похожим на состав его нефункционального окружения, он будет "смешиваться" с этим окружением. Этот процесс получил название композиционной ассимиляции.
Второй процесс характеризуется тем, что псевдоген становится все короче, по сравнению с функциональным геном. Это сокращение длины вызывается тем, что делеции преобладают над инсерциями. Оценки показывают, что процессированные псевдогены млекопитающих теряют около половины своей ДНК примерно за 400 миллионов лет. Процесс этот очень медленный, геном человека, например, все еще содержит основные участки ДНК псевдогенов, найденные у самых отдаленных предков. Очевидно, что эти древние псевдогены к настоящему времени потеряли практически любое сходство со своими функциональными гомологами.