Генные и видовые деревья
Филогенетическое дерево может представлять пути эволюционного развития группы таксономических единиц (видов) или же группы генов. В первом случае дерево называют видовым, а во втором генным.
Генные и видовые деревья могут отличаться друг от друга по крайней мере в двух аспектах ( рис деревья 2 ).
Во первых, дивергенция двух генов может предшествовать дивергенции двух видов. Эта ситуация представлена на верхнем рисунке. В результате, при попытке вычислить время дивергенции двух видов мы получим завышенные оценки. Следует заметить, что при оценке далеких событий эта ошибка уменьшается.
Во вторых, топология дерева генов и видового может быть различной. Эта ситуация приведена на нижнем рисунке .
Топология деревьев a) и b) для генных и видовых деревьев совпадает, а в случае c) топология различна. Вероятность получения ошибочной топологии очень высока, если время между двумя событиями видообразования коротко. Для того, чтобы избежать подобных ситуаций следует использовать много разных генов при реконструкции филогении.
