Влияние отбора на фиксацию мутаций
В настоящее время получены данные о влиянии отбора на фиксацию мутаций в составе определенного полинуклеотидного контекста или в определенных участках последовательности. Известно, что различия в скоростях фиксации мутаций между семействами белков связаны в основном с разными функциональными ограничениями, накладываемыми на конкретный белок. В ходе эволюции замены могут фиксироваться только в пределах определенного набора позиций ( коварионах ), допустимого этими ограничениями (см.обзор: Ратнер и др., 1985 ). В том случае, если коварионы располагаются в составе определенного контекста, мутации, соответственно, также будут фиксироваться в составе этого контекста. В данном случае связь мутаций с контекстом может быть опосредована не через молекулярные механизмы их возникновения, а через отбор, который накладывает ограничения на фиксацию мутаций. Так в случае рРНК могут отбираться такие мутации, в результате которых уменьшается число несовпадений в комплементарных палиндромах , образующих вторичную структуру рРНК ( Hancock et al., 1988 ). Результат такого отбора может быть неотличим от механизма репарационной коррекции комплементарных палиндромов. Это может создавать большие сложности при анализе таких ситуаций.
Необходимо подчеркнуть, что в данной работе не рассматривается проблема влияния отбора на фиксацию мутаций в составе определенного полинуклеотидного контекста по причине отсутствия четких экспериментальных данных, которые позволили бы оценить количественно это влияние. Единственным исключением является исследование причин неслучайно частой фиксации мутаций в гипервариабельных районах V-генов по сравнению с каркасными районами.
