ДНК повторяющиеся последовательности: общие сведения
В геноме многоклеточных организмов имеется большое количество некодирующих повторяющихся последовательностей. Повторяющаяся ДНК (repetitive DNA): нуклеотидные последовательности , повторяющиеся в хромосомной ДНК. Различают высокоповторяющуюся, умеренно и низкоповторяющуюся ДНК. Фракция высокоповторяющейся последовательности ДНК содержит миллионы копий повторов на геном. Фракция умеренно повторяющейся ДНК содержит от 100 до 10000 копий фрагментов. Более низкая копийность повторов соответствует низко повторяющейся фракции.
Хорошо изученным представителем первых является сателлитная ДНК , которая состоит из коротких тандемных повторов длиной 1-20 п.о., организованных в длинные блоки.
Повтор длины L с K различиями - это два участка последовательности, имеющих длину L нуклеотидов каждый и различающихся по K нуклеотидам. Примеры повторов приведены на рисунке. Нарушения комплементарности или гомологии отмечены знаком (*).
* * * *
------- >------->-------------->...TACTGGCA ... TACTGCCA... ...TACTGGCATACTGCCA... ...ATGACCGT ... ATGACGGT... ...ATGACCGTATGACGGT...
прямой повтор тандемный повтор
* *
------->------- >...TACTGGCA ... TGCCTGTA... ...TACTGGCATGCCTGTA... ...ATGACCGT ... ACGGACAT... ...ATGACCGTACGGACAT...
Ссылки:
- Разрезание ДНК
- Бактериофаг M13
- Выщепление транспозонов
- Индуцированный мутагенез
- ДНК-Инвертазы
- Нестабильность палиндромов
- Делеции и повторы ДНК
- Генетика соматических клеток и рекомбинантных ДНК в картировании генов
- Делеции, дупликации и инсерции протяженных фрагментов
- Заключение о связи полинуклеотидного контекста с возникновением мутаций и рекомбинаций.
- Репарация гетеродуплексов и повторы ДНК
- Семейство Tn3
- Влияние отбора на фиксацию мутаций
- Анализ связи точек рекомбинаций с короткими повторами
- Контролирующие механизмы незаконной рекомбинации