Семейство Tn3
Транспозоны этого семейства произошли из G+ и G- бактерий [см. 95 и 108 ]. Они кодируют два белка, транспозазу и ре- сольвазу , которые воздействуют, соответственно, на инвертирован- ные повторы длиной 34-40 пар оснований, присутствующие на концах транспозона, и на сайт res длиной 120 пар оснований. Эти элементы подвергаются репликативной транспозиции , которая может генериро- вать делеции и инверсии , когда последовательность-мишень находит- ся в транспозон-содержащей молекуле. В дополнение к таким измене- ниям, которые являются следствием "законной" транспозазной актив- ности и не обсуждаются в обзоре, наблюдалось, как некоторые тран- спозазы семейства Tn3 (Tn3, Tn21, Tn1000, Tn1721) опосредовали сшивание донорных плазмид , содержащих только один (вместо двух) транспозонный конец с плазмидами-мишенями [ 10 , 11 , 41 , 109 ]. Этот процесс сформулировали как "одноконцевая транспозиция" [ 200 ].
Продукты вставки представляли собой плазмиду-мишень целиком и различные количества донорных плазмид. Большинство продуктов, по- лученных с Tn21 или с Tn1721 (>60%) содержало более одной целой донорной плазмиды, в остальных были только части донорных плазмид. Вставки появлялись во многих сайтах плазмиды-мишени. Один из новообразованых стыков всегда содержал транспозонный конец донора, в то время как другой стык варьировал. Любой транспозонный конец (правый или левый) мог опосредовать вставку в присутствии соот- ветствующей транспозазы. Анализ последовательностей четырех сты- ков, сгенерированных Tn21, и четырех, сгенерированных Tn1721 [ 201 ], показал короткие (от 5 до 6 н.п.) дупликации последова- тельности-мишени, которые окружали донорный материал. Последова- тельности варьирующих стыков не имели очевидной гомологии с транспозонными концами. Предполагаемые механизмы одноконцевой транспозиции представлен ниже.
