Механизмы одноконцевой транспозиции
Одноконцевая транспозиция может рассматриваться в контексте "законной" транспозиции, за исключением того, что транспозаза ис- пользует один правильный конец и одну отличающуюся последователь- ность вместо двух правильных концов. Процесс может быть иницииро- ван расщеплением и перемещением нитей в правильном конце и терми- нирован в отличающемся конце [ 201 ] в линии с асимметричными мо- делями транспозиции [ 96 ]. Напротив, одновременное расщепление правильной и отличающейся последовательностей, сопровождающееся перестановкой нитей, может происходить [ 97 ] как предусмотрено симметричными транспозиционными моделями [ 95]. Обе модели основаны на предположении, что транспозаза переставляет нити в обоих стыках. В случае Tn21 и Tn1721, гипотеза подтверждается наблюдением, что последовательность ДНК-мишени длиной 5 или 6 н.п. была дуплицирована в продуктах стыковки как и в случае регулярной транспозиции [ 201 ].
Во всех случаях, одноконцевая транспозиция была менее эффек-
3 тивна, нежели регулярная транспозиция. Разница составляла 10 для
2 Mu и Tn3, 10 для Tn1000 и Tn1721, и только 10 для Tn21. Это может быть следствием множества причин, таких как уровень различных транспозаз в клетке, типы последовательностей, фланкирующих концы транспозонов, родство различных транспозаз к последовательностям, которые дивергируют от правильных концов транспозона. Сравнение транспозаз семейства Tn3 , являющихся близкородственными, может позволить найти особенности, определяющие уровень их субстратной специфичности.
