Формирование коинтегратов
Интермолекулярное формирование коинтегратов может происходить не только в результате делеций и дупликаций , которые можно просто считать случаями интермолекулярной рекомбинации, но и путем рекомбинации между короткими гомологичными последовательностями . Это было показано анализом коинтегратов между фагом лямбда и плазмидой pBR322 (или ее производными) [ 144 ]. Три из четырех выделенных коинтегратов произошли из одного рекомбинационного события между гомологичными последовательностями длиной 10 или 11 н.п., четвертый был сформирован двумя рекомбинационными событиями. В обоих случаях использовались гомологичные последо- вательности длиной 10 и 13 н.п. Интересно, что некоторые другие коинтеграты, изолированые в recA клетках, возникали в результате множественных рекомбинационных событий между последовательностями, имеющими меньшую гомологию (<5 ="187 ].
Роль коротких гомологий в формировании коинтегратов также бы- ла документально определена в B.subtilis [ 17a ]. Коинтеграты были изолированы путем отбора на поддержание термочувствительной плаз- миды (pE194) при рестриктивной температуре в клетках, несущих термоустойчивые плазмиды. Из 22-х изученых плазмид, 21 была сформирована путем рекомбинации между гомологиями в 9-15 н.п., часто фланкироваными дополнительными короткими районами гомологии. Было найдено 9 различных стыков,один из них использовался в 12 из 22 случаях, причем использовал гомологию только 11 н.п., намного короче, чем длиннейшая (15 н.п.), или частичную (42/49) гомологию. Также было найдено, что pE194 интегрирует в хромосому B.subtilis путем рекомбинации между последовательностями, гомологичными по 15 из 16 н.п. [ 17b ].
Все это говорит о том, что рекомбинация между короткими гомо- логичными последовательностями приводит к множеству различных преобразований. Принимая во внимание разнообразие этих гомологий, можно прийти к выводу, что большинство преобразований не формиру- ется специфичными к последовательностям ДНК ферментами систем разрезания и сшивания.
