Физический масштаб генетических карт
Рекомбинационные расстояния всегда условны. Это связано с тем, что они отражают не только (и не столько) структуру - распределение генов по хромосоме, сколько функцию - процесс обмена участками гомологичных хромосом . Единицы рекомбинационных расстояний - частоты кроссоверных обменов - не имеют прямого отношения к единицам измерения физических расстояний. Между тем, во многих экспериментах возникает необходимость знать физический масштаб генетических карт - какому расстоянию на ДНК в нуклеотидных парах соответствует один сантиморган .
Для решения этой задачи необходимо знать размер генома в нуклеотидах, а также среднее число кроссоверных обменов на геном. Такой способ оценки масштаба генетических карт дает усредненные значения. Локальные масштабы могут существенно отличаться. Это может быть связано с неравномерным распределением кроссоверных обменов по хромосоме. (Результаты экспериментальных исследований показывают, что плотность кроссоверных обменов на единицу физической длины хромосомы может различаться более чем на порядок (см. Высоцкая,1987 ; Жученко, Король,1985 ; White,1954 ). Очевидно, что при этом на порядок будут различаться и локальные масштабы генетических карт).
Другим фактором, который способен существенно изменить масштаб карты, служит межвидовая вариабельность размеров генома. Известно, что количество ДНК на геном может существенно варьировать в пределах рода. Родственные виды могут различаться по количеству ДНК почти на два порядка ( Бирштейн,1987 ). Сравнительный анализ не выявляет общие, не зависящие от таксона тенденции в изменении количества ДНК ( Bachman et al.,1977 ). Размеры хромосом в нуклеотидных парах у разных видов могут различаться на 6-7 порядков ( Sparrow et al.,1977 ). Если вспомнить о том, что по числу хиазм хромосомы различаются не на несколько порядков, а на несколько хиазм, можно представить, как сильно различаются масштабы генетических карт разных хромосом.
Таким образом, масштабы карт могут существенно различаться для разных участков генома в пределах вида, а также между видами. Основными источниками такой изменчивости являются неравномерность распределения кроссоверных обменов по геному и вариабельность размеров генома.
