Ошибки репликации и незаконная рекомбинация
Аппарат репликации ДНК , работающий на данной матрице , может оставаться на ней или переключиться на другую, гомологичную , матрицу. Если происходит переключение, то синтезированная ДНК является копией первой матрицы в области 5' от сайта переключения и копией второй матрицы в области 3' от этого сайта. Ошибка при переключении должена зависеть от относительного расположения последовательностей, по которым идет переключение. Так, будет получена делеция , если аппарат репликации был перемещен на гомологичную последовательность, расположенную в том же геноме в 3' направлении, так как не был бы реплицирован район генома , фланкированный гомологичными последовательностями. Напротив, если бы репликационный аппарат был перемещен в 5'направлении, произозошла бы дупликация , так как район, фланкированный гомологичными последовательностями был бы реплицирован дважды.
Первое документальное свидетельство переключения матрицы было получено in vitro. Экстенсивная репликация ДНК-дуплекса ДНК-поли- меразой I (PolI) дает быстро ренатурирующие, ветвящиеся структуры [ 155 , 188], что позволяет предположить, что фермент реплици- рует одну из двух нитей ДНК, одновременно вытесняя вторую и, не дожидаясь полной репликации первой нити, переключается на вытес- ненную и продолжает копировать эту новую матрицу.Ветвящаяся двой- ная ДНК может получаться при повторяющемся переключении матрицы.
