Строение ионной поры потенциал-активируемых каналов
Общим признаком аминокислотных последовательностей всех потенциал-активируемых каналов является умеренно гидрофобный участок во внеклеточной петле между S5 и S6 сегментами ( рис. 3.6 ). Так же как в экспериментах, описанных ранее для М2 участка АХР , мутации в этом участке калиевого канала Shaker снижали сродство канала для блокирующего действия тетраэтиламмония (TEA) и изменяли проводимость канала . Было сделано заключение, что этот участок погружен вглубь канала и принимает участие в формирования ионной поры. Этот вывод подтверждался также данными рентгеновской дифракций канала ( рис. 3.7 ). Петля S5-S6 формирует короткую спираль, которая погружена в центр канала; аминокислоты, восходящие от нижнего конца спирали, образуют верхнюю часть ионной поры ( рис. 3.6 D).
Мутации в области поры существенно затрагивают ионную избирательность потенциал-активируемыл ионных каналов. Например, в натриевых каналах мозга крысы замена в области поры в третьем домене положительно заряженного глутамата на отрицательно заряженный лизин приводит к появлению характеристик, свойственных кальциевым каналам . Вместо селективной проницаемости для натрия мутантный канал имеет низкую избирательность для моновалентных катионов. Кроме того, при физиологических концентрациях ионов, болыиая часть тока через такой канал обеспечивается кальцием.