Рак груди - аллельная потеря или аллельный дисбаланс
Три проблемы затрудняют сравнение генотипов нормальной и опухолевой ДНК пациента больного раком груди.
Во-первых, многие биопсии опухолей содержат значительное количество нетрансформированных клеток, которые мешают выявлению потери гетерозиготности опухолевыми клетками.
Эмпирическим путем установлено, что в образцах опухоли более 50% опухолевых клеток дают надежные результаты по скринингу LOH, что соответствует более 80% подобным образом проанализированных пациентов.
Во-вторых, большинство из наблюдаемых хромосомных изменений могут демонстрировать существенный процент гетерогенности опухоли, что также может маскировать действительную аллельную потерю в опухоли.
В-третьих полиморфные маркеры ДНК выявляют любой дисбаланс в родительских аллелях, как потерю аллеля, так и приобретение ряда аллельных копий.
Несколько цитогенетических исследований подчеркивает, что приобретение нескольких хромосомных копий, является одним из наиболее характерных изменений при раке груди ( Раздел цитогенетические исследлвания ).
На практике всегда трудно провести границу между различными интерпретациями наблюдаемого дисбаланса в аллельных сигналах опухолевых ДНК, по сравнению с нормалной ДНК [ Devilee P.,Cornelisse C.J., 1990 ].
Хотя мы применяем термин аллельный дисбаланс ( AI ) в каждом подобном случае, независимо от того, является ли это потерей или приобретением аллеля [ Devilee P., Cornelisse C.J., 1990 , Devilee P., Van Vliet M., ea, 1991 ], мы также прибегаем к термину LOH .
В ряде исследований выявлено, что около 80% случаев аллельного дисбаланса является аллельной потерей.
Приобретение числа аллельных копий особенно часто найдено в хромосоме 1 , что согласуется с цитогенетическими наблюдениями [ Devilee P., Van Vliet M., ea, 1991 , Bieche I., Champeme M.-H., ea, 1993 ].
