РНК-проводники (guide RNA, gRNA. РНК редактирование)

РНК-проводники определяют места редактирования. РНК-проводники - небольшие молекулы, которые комплементарны по отношению к редактируемым РНК-областям. Кроме того, они имеют дополнительно 3' уридиловый конец (от 5 до 24 нуклеотидов), который, вероятно, добавляет фермент TUTase - терминальная уридилтрансфераза [ Benne ea 1996 ].

У паразитического простейшего Leishmania tarentolae идентифицированы и клонированы 13 gPHK, кодируемых максикольцевой, и 43 gPHK, кодируемых миникольцевыми ДНК-молекулами [ Simpson ea 1995 ]. Длительное культивирование in vitro L.tarentolae привело практически к полной утрате генов gPHK, необходимых для редактирования тех мРНК, белковые продукты которых теряли свое значение для выживания в культуре. Это говорит о лабильности признака эдитинга у трипаносом [ Thiemann ea 1994 ]. Митохондриальная ДНК трипаносом состоит из приблизительно 50 сцепленных максиколец размером 23-36 тпн (в зависимости от вида) и содержат структурные и рРНК гены и несколько специальных генов РНК-проводников (guide RNA, gRNA) ; от 5 до 10 000 сцепленных миниколец кодируют все остальные gPHK [ Simpson ea 1995 ]. Количество различных генов РНК-проводников в клетках видоспецифично. У Trypanosoma brucei предполагают наличие более 300 классов миниколец. Обычно одна миникольцевая ДНК кодирует три молекулы РНК-проводника, разделенных 18-членными инвертированными повторами, а у Leishmania tarentolae каждое миникольцо кодирует лишь один РНК-проводник [ Simpson ea 1995 ]. См. РНК редактирование мРНК кинетопластных простейших: механизм

Ссылки: