PTGS: активность RdRP у растений
У растений было показано, что ген sde1/sgs2 , кодирующий предполагаемую РНК-зависимую РНК-полимеразу (RdRP) , необходим для PTGS , вызванного трансгенами, но не вирусами ( Dalmay et al., 2000b ; Mourrain et al., 2000 ). В соответствии с этим, мутация в гене sde1/sgs2 приводит к исчезновению siRNA , образуемых при PTGS трансгена, но не вируса ( Dalmay et al., 2000b ).
Независимость вирус-индуцированного PTGS от клеточной RdRP видимо объясняется тем, что большинство вирусов способно образовывать двухцепочечную РНК с помощью своих собственных ферментов.
В случае PTGS, вызванного трансгенами, в том числе экспрессирующими только смысловую РНК, активность клеточной RdRP должна играть центральную роль в синтезе двухцепочечной РНК (кроме трансгенов, содержащих инвертированный повтор, которые сразу могут экспрессироваться с образованием двухцепочечной РНК). Предполагается, что RdRP узнает необычные, аберрантные молекулы РНК, образуемые при транскрипции трансгенов. Очевидно, что на этапе инициации PTGS при узнавании матрицы для синтеза активность RdRP должна быть праймер-независимой, но тем не менее высокоселективной, чтобы исключить синтез двухцепочечной РНК для нормальных клеточных генов.
Таким образом, при PTGS у растений именно RdRP должна играть главную роль в инициации репрессии, обеспечивая специфичность процесса.
