RdRP (РНК-зависимая РНК-полимераза)

RdRP - РНК-зависимая РНК-полимераза (RNA-dependent RNA polymerase) - фермент, обнаруженный у растений и у С. elegans ( Dalmay et al., 2000 ; Sijen et al., 2001 ).

Клеточный фермент RdRP был найден ранее у растений, однако его функции были неизвестны ( Schiebel et al., 1993a ; Schiebel et al., 1993b ). Было показано, что гены, имеющие гомологию с РНК-зависимой РНК-полимеразой томатов, участвуют в PTGS у растений, quelling у Neurospora и РНК-интерференции в герминальной ткани C. elegans ( Cogoni and Macino, 1999a ; Dalmay et al., 2000b ; Mourrain et al., 2000 ; Smardon et al., 2000 ).

RdRP, белок, подобный белку " Argonaute ", который, как полагают, участвует в направляемом малыми интерферирующими РНК (siRNA) расщеплении иРНК ( Baumberger and Baulcombe 2005 ).

RdRP использует siRNAs в качестве праймеров для генерации большого количества dsRNA, которые затем могут процессироваться Dicer в дополнительные siRNA. Таким образом, считается, что первичная функция RdRP - амплификация RNAi -ответа, но RdRP может играть и более специфическую роль в инициации синтеза dsRNA (см. " Синтез dsRNA и образование siRNA "). Действительно, она, по-видимому, участвует в процессе, приспособленном для формирования лучшей защитной реакции хозяина в ответ на введение экзогенной dsRNA. Эта идея подкрепляется тем фактом, что RdRPs не являются участниками путей сайленсинга с помощью miRNA ( Sijen et al., 2001 ). Интересно, что в геномах насекомых (в том числе Drosophila) и позвоночных (включая млекопитающих) отсутствуют распознаваемые RdRP-подобные последовательности, но остается возможность, что у этих организмов синтез dsRNA выполняют другие полимеразы.

 Репликация РНК вируса табачной мозаики осуществляется РНК-зависимой РНК-полимеразой , закодированной в геноме вируса. Сначала этот фермент строит комплементарную цепь РНК, так называемую минус-цепь (она не кодирует белки в отличие от вирусной РНК, кодирующей белки и поэтому называемой плюс-цепью), а затем по ней, как по матрице, синтезирует множество вирусных РНК.

Ссылки:

Все ссылки