Репрессия транспозонов: механизм, основанный на гомологии
В соответствии с предположением о репрессии мобильных элементов механизмом, связанным с образованием двухцепочечной РНК , короткие РНК, соответствующие последовательностям ретротранспозонов, были обнаружены у дрозофилы ( Elbashir et al., 2001b ), трипаносомы ( Djikeng, 2001 #1026) и у растений (A. Hamilton, личное сообщение).
Однако в то время как в некоторых случаях их размер соответствовал размеру siRNA , образуемых при искуственной РНК-интерференции у этих организмов ( Elbashir et al., 2001b , Djikeng, 2001 #1026), в других случаях, например в случае ретротранспозонов gypsy и I-элемента дрозофилы (A. Bucheton, A. Pellisson, личное сообщение) и ретротранспозонов растений (A. Hamilton, личное сообщение), размер коротких РНК несколько превышал размер siRNA и составлял от 26 до 30 нуклеотидов.
Каким образом мобильные элементы вызывают запуск механизма репрессии, основанный на распознавании двухцепочечной РНК?
С одной стороны, транскрипция мобильных элементов по обеим цепям благодаря наличию внутренних антисмысловых промоторов ( Lankenau et al., 1994 ; Minchiotti and Di Nocera, 1991 ) или транскрипции с внешних клеточных промоторов может приводить к непосредственному образованию двухцепочечной РНК. И действительно, наличие одновременно смысловых и антисмысловых транскриптов было показано для некоторых мобильных элементов ( Danilevskaya et al., 1999 ; Ilyin et al., 1980 ).
С другой стороны, транскрипция только смысловой цепи часто приводит к синтезу транскриптов мобильных элементов, которые могут распознаваться как аберрантные и вести к образованию двухцепочечной РНК при помощи RdRP .
Участие только генов II группы РНК-интерференции в подавлении активности транспозонов у C. elegans предполагает, что мобильные элементы не образуют двухцепочечную РНК, идентичную искуственно введеной двухцепочечной РНК.
Альтернативное объяснение полагает, что двухцепочечная РНК транспозонов образуется еще в ядре и вначале проходит стадии, отличные от инъецированной двухцепочечной РНК, что может также объяснить и разницу в размерах коротких РНК в этих случаях.
