сплайсинг: мутации в интронах
В этом случае новый сайт может выключить из реакции нормальный сайт. В одном эксперименте мутация приводит к образованию нового сайта сплайсинга рядом с 3' концом интрона. Справа от него активизируется также ложный 3' сайт сплайсинга. В результате образуется РНК с дополнительным экзоном, представляющим собой часть первоначального интрона.
Тот факт, что такие мутации происходят лишь вблизи границ интрона означает относительно слабую специфичность в последовательности брэнч сайта.