Сплайсинг: одиночный активный сайт и транслокация
При сплайсинге свободная молекула гуанозина садится на 5' сайт сплайсинга; в разрезанном интроне с блокированым 3' концом, свободный гуанозин может взаимодействовать с сайтом циклизации. Во всех случаях сайту взаимодействия предшествует трипиримидиновая последовательность. Все катализируемые РНК реакции происходят на одном активном сайте.
Модель структуры пре-рРНК Tetrahymena аналогична моделям для разных митохондриальных пре-РНК. Согласно этой модели, внутренняя управляющая последовательность соответствует 5' и 3' экзонам. UCU предшествующая 5' сайту сплайсинга спаривается с GGA. При такой рекции необходимы конформационные изменения, чтобы свести вместе различные олигопиримидиновые последовательности и активный сайт для взаимодействия с гуанозином. Этот транслокационный этап похож на синтез белков на рибосомах, когда говорят о взаимодействии триплетов.