Пре-рРНК Tetrahymena
Ауто-сплайсинг : У многих видов Tetrahymena , простейших реснитчатых, каждая копия ядерного 26S rRNA гена содержит интрон длиной около 400 н-ов. Сплайсинг является ранней стадией процессинга РНК. Интроны вырезаются как дискретные линейные молекулы, последовательно переходящие в кольцевую форму.
Вырезание интронов и сшивание экзонов происходти in vitro при инкубации пре-рРНК в растворе содержащем гуанозин, Mg2+ и соль без белков. Есть еще несколько случаев, когда сплайсинг происходит без участия белков и таким образом является процессом, внутренне присущим РНК.
При аутосплайсинг е и аутокаталитических реакциях ковалентные связи в РНК рвутся и перестраиваются. Таким образом РНК - нестандартный катализатор.
Три типа аутосплайсинга: Для сплайсинга пре-рРНК Tetrahymena предложен двухэтапный механизм ( см.рис .) Оба этапа происходят посредством трансэстерификации, обмена фосфатных esters. Этот механизм обьясняет каким образом сшивание РНК происходит без участия внешнего источника энергии, каким часто является гидролиз АТФ или ГТФ. 3'-гидроксильная группа свободной молекулы гуанозина действует как нуклеофил, воздействующий на 5' сайт сплайсинга. Эта реакция освобождает 3' гидроксильную группу на конце 5'-концевого экзона, которая затем работает как нуклеофил для второй реакции трансэстерификации.
Все реакции, включающие два этапа сплайсинга и реакции циклизации могут быть разделены на три группы: а) трансэстерификацию гуанозина за которым следуют 2 или 3 пиримидина; б) трансэстерификацию олигопиримидинов (таких как 5'-экзон, заканчивающийся последовательностью CUCUCU-OH), происходящую на фосфатах, следующих за 3'- концевым гуанозином интрона; в) специфический гидролиз сайта сплайсинга;
