Интроны РНК группы II

Небольшая группа митохондриальных IVS имеет консервативные последовательности и вторичную структуру, отличную от интронов группы I . Они названы интронами группы II . Один из них, последний интрон дрожжевой митохондриальной мРНК охидазы цитохрома, подвергается аутосплайсингу in vitro. Также как и сплайсинг интронов группы I, реакция требует присутствия ионов Mg2+. Отличие состоит в отсутствии необходимости присутствия гуанозина или любого другого нуклеотида в качестве субстрата.

Механизм сплайсинга предшественников группы II имеет общие черты с механизмом сплайсинга пре-мРНК группы I . Оба процесса являются двухэтапными реакциями трансэстерификации, при которых на первом этапе происходит разрыв 5' сайта сплайсинга, а на втором разрыв 3' сайта сплайсинга и сшивание экзонов. Второй этап совершенно одинаков у обеих групп, а первый различается. В интронах группы I нуклеофильным является 3' гидроксильная группа гуанозина связанного с РНК, в интронах группы II - 2' гидроксильная группа нуклеотида в цепочке РНК. Благодаря этой группе формируется структура лариата.

Ссылки: