Таб.01 spl Элайнмент структур U4 мяРНК

           Stem II                   5'Stem/Loop                 Stem I 
          
************************************************************************ 
           *          10           20         30        40         50      
   60 *
           *.AUCCUUAUGCAC.GGGAAA U ACGCAUAUC AGUGAGGAUUCGUCCGA GAUUGUGU UUU
UGCUGG*S.c. 
           *.AUCCUUAUGCAC.GGGAAA U ACGCAUAUC AGUGAGGAUUCGUCCGA GAUUGUGU UAU
UGCUGG*K.l. 
           *AAUGCUUGCGCA..GGGAGG U GUGAA.CGC AA.GAUCCUCAGG.UGA UUGUUCAC UAG
UGC.AA*Trip 
           *.AUCUUUGUGCUUGGGGCAA U GACGUAGCU AGUGAGGAUUCGAACGA GGCGCGUC UAU
UGCUGG*Bean a 
           *.AUCCUUAUGCAC.GGGAAA U ACGCAUAUC AGUGAGGAUUCGUCCGA GAUUGUGU UAU
UGCUGG*Bean b 
           *.AGCUUUGCGCUC.GGGAAA U AACGUGACC AAUGAGG.CUUUGCCGA GGUGCGUC UAU
UGCUGG*Worm 
           *                                                               
      * 
           *.A.CYUuRYGC....GG.RR U R.....ryY ARuGArg.YY...cYGA gry....Y Uau
UGCuRR*Cons 
          
************************************************************************
                                5 ' Концевой домен 
Приведены выравненные последовательности
 S.c. (Saccharomyces cerevisiae), 
 Bean (Vicia faba), 
 Trip (Trypanasoma brucei), 
 K.l. (Kluyveromyces lactis), 
 Worm (Caenorhabditis elegans).  
 РНК произвольно разделена на три домена. 
 Стебли I и II относятся к внутримолекулярным спиралям формируемым с U6.
  Sm относится к консенсусу сайта связывания белка Sм.         (
СМ. ДАЛЕЕ
) Данные взяты из 
Guthrie C., Patterson B. 1988
		



Ссылки: