Таб.02 spl Элайнмент структур U4 мяРНК

Central Stem /Loop 
************************************************************************
*    70         80        90        100       110               120    * 
*GAAAUUUAAUUAUAAACCA.GACCGUC UCCUCAUGGUCAAUUCGGUGUUCG CUUU......
UGAAUA*S.c. 
*GAAAUUU.AUUUUUAACCAUGACCUCC UCCUCAUAACGUAUUGUGU..... CUUUCAUUUU
.....A*K.l. 
*........ACUAUAU.CCGGUAC.... UCC..................... .UUCGG....
......*Trip 
*GAAA....ACUAUUUGCCAA.ACC..C CUCUUAGGCUUGGG.......... CUUGGG....
......*Bean a 
*GAAA....ACUAUUU.CUAA.ACCC.C CUCUUAGGCUUGAG.......... .UUUAA....
......*Bean b 
*GAAA....ACUUUUC.CCAAUUGCC.C CUCUUAGGCUUGAG.......... .UGAAACAU.
......*Worm 
*                                                                      * 
*gaaa....AYU.U...Cca..acc..C .Yc.yr.................. .U...r...........* 
************************************************************************
Центральный домен  
Приведены выравненные последовательности 
S.c. (Saccharomyces cerevisiae), Bean (Vicia faba), 
Trip (Trypanasoma brucei), 
K.l. (Kluyveromyces lactis), 
Worm (Caenorhabditis elegans).  
РНК произвольно разделена на три домена. 
Стебли I и II относятся к внутримолекулярным спиралям формируемым с U6. 
Sm относится к консенсусу сайта связывания белка Sм.         
(СМ. ДАЛЕЕ) Данные взяты из Guthrie C., Patterson B. 1988

		



Ссылки: