Таб.03 spl Элайнмент структур U4 мяРНК

Sm Site            3' Stem/Loop 
*************************************************** 
*      150                                  160   * 
* AAUUUUUGG ---- ------  ---- ------- AA..UACCUUU *  S.c. 
* AAUUUUUGG ---- ------  ---- ------- AACCUACCU.. *  K.l. 
* AAGUU.UGC UA.. .CCCACC .ACG GGUGGG. A.......... *  Trip 
* AAUUUCUGG AAGG ..ACUCC CUUU GGGGU.. AAAGUCUA... *  Bean a 
* AAUUUCUGG AAGG ..ACUCC .UUC GGGGU.. AAAGUCUA... *  Bean b 
* AAUUUUUGA AC.. ..GCCUC UAG. GAGGC.. AGGA....... *  Worm 
*                                                 * 
* AAuUUyUGr .... ....YyC .... YrR.... ........... * 
***************************************************
3 ' Концевой домен  
Приведены выравненные последовательности 
S.c. (Saccharomyces cerevisiae), 
Bean (Vicia faba), 
Trip (Trypanasoma brucei), 
K.l. (Kluyveromyces lactis), 
Worm (Caenorhabditis elegans).  
РНК произвольно разделена на три домена. 
Стебли I и II относятся к внутримолекулярным спиралям формируемым с U6. 
Sm относится к консенсусу сайта связывания белка Sм. 
Данные взяты из Guthrie C., Patterson B. 1988

		



Ссылки: