Таб.04 spl Элайнмент структур U6 мяРНК

5 ' Stem/Loop 
************************************************************************ 
*           10                20       *  30        40        50       * 
*...GUUCGCGAAG.. UAACC. ..CUUCGUGGACAU * UUGGUCAAUUUGAAACAAUACAGAGAU   *
S.c. 
*..AGUCCAUAUUACC CUCCGU GGUUUUAUGGACAU * UUGGUCAAUUUGAAACAAUACAGAGAU   *
K.l. 
*GCAGCCC........ .UUCG. .......GGGACAU * CCA.CAAACUGGAAAUUCAACAGAGAA   *
Trip 
*      C........ .UUCG. .......GGGACAU * CCGAUAAAAUUGGAACGACACACAGAA   *
Bean 
*...GUUCU....... .UCCG. .......AGAACAU * AUACUAAAAUUGGAACAAUACAGAGAA   *
Worm 
*                                      *                               * 
*...GuyC........ .uYcG. ........GrACAU * .YR.u.AA.UuGRAAcra.ACAGAGA.   *
Cons 
************************************************************************
5 ' Концевой домен                  Центральный домен  
Приведены выравненные последовательности 
S.c. (Saccharomyces cerevisiae), 
Bean (Vicia faba), Trip (Trypanasoma brucei), 
K.l. (Kluyveromyces lactis), Worm (Caenorhabditis elegans).  
РНК произвольно разделена на четыре домена. 
Стебли I и II относятся к внутримолекулярным спиралям формируемым с U4.
(СМ. ДАЛЕЕ) 
Данные взяты из Guthrie C., Patterson B. 1988

		



Ссылки: