Таб.05 spl Элайнмент структур U6 мяРНК

Stem I    Stem II 
************************************************************************ 
*    60         70        80 *          90          100         110    * 
*GAUCAGCA GUUCCCCUGCAUAAGGAU * GAACCGUUUUACAAA....GAGAUUUAUUUCG..UUUU 
*S.c. 
*GAUCAGCA GUUCCCCUGCAUAAGGAU * GAACCGUUUUACAAA....GAGAUUUAAGA....UUUU 
*K.l. 
*GAUCAGCA GUUCCCCUGCAUAAGGCU * GAUGU......CAAUCUUCGAGAUUUAUAGC...UUUU 
*Trip 
*GAUCAGCA UGGCCCCUGCGCAAGGAU * GACACG...CACAAA..UCGAGAUUUAUAGCAAAUUUU 
*Bean 
*GAUCAGCA UGGCCCCUGCGCAAGGAU * GACACG.....CAAA.UUCGUGAAGCGUUCCAAAUUUU 
*Worm 
*                            *                                         * 
*GAUYAGCA ...cCCCUGCRYAAGGaU * GA..cg.....CAAa....G.GA..YR...c...UUUU 
*Cons 
************************************************************************
домен взаимодействия с U4               3' концевой домен
  
Приведены выравненные последовательности 
S.c. (Saccharomyces cerevisiae), 
Bean (Vicia faba), 
Trip (Trypanasoma brucei), 
K.l. (Kluyveromyces lactis), 
Worm (Caenorhabditis elegans).  
РНК произвольно разделена на четыре домена. 
Стебли I и II относятся к внутримолекулярным спиралям формируемым с U4. 
Данные взяты из Guthrie C., Patterson B. 1988

		



Ссылки: