ТРАНСКРИПЦИОННЫЕ ФАКТОРЫ: КЛАСС: ТФ 2.3 с цинк пальцами типа Cys2 His2
Этот класс включает белки с различными функциями. Многие из них являются истинными транскрипционными факторами. В других цинковые пальцы являются скорее всего РНК-связывающими или димеризационными доменами. В рассматриваемую классификацию включены только те белки, роль которых в регуляции транскрипции доказана (или предполагается с большой вероятностью). Для этих факторов еще не сформировался подход, позволяющий связать способ, используемый ими для образования комплекса с ДНК, с биологической ролью этих ТФ. Поэтому выделение семейств в этом классе осуществлено в соответствии с основными биологическими эффектами, которые могут оказывать представители того или иного семейства.
Все факторы содержат мотив "цинковые пальцы" типа TFIIIA/Krueppel, в котором каждый палец включает по два остатка Cys и His, координирующих ион Zn2+ . В некоторых случаях один остаток His может быть заменен на остаток Cys. Ион Zn2+ необходим для взаимодействия факторов с ДНК. Первая половина аминокислотной последовательности пальца обычно образует два антипараллельных бета-слоя, а вторая половина организована в альфа-спираль и частично 3-10-спираль. Гидрофобные связи между бета-слоями и альфа-спиралями образуются при участии консервативных остатков Phe и Leu. Факторы взаимодействуют с большой бороздкой ДНК альфа- спиральными участками полипептидных цепей. Последовательность аминокислот, связывающая пальцы, чаще всего TGEKPI.
В классе пять семейств:
1) повсеместно распространенные факторы ( TFIIIA , Sp1 , YY1 ; всего пять факторов);
2) регуляторы развития или клеточного цикла (подсемейства: Egr/Krox , Kruppel-подобные факторы , GLI-подобные факторы и прочие факторы; всего 36 факторов);
3) метаболические регуляторы грибов ( CE2 , CreA ; всего шесть факторов);
4) большие факторы с NF-kB-подобными ДНК-связывающими свойствами ( HIV-EP1 , альфаA-CRYBP1 , AGIE-BP1 ; всего шесть факторов);
5) регуляторы вирусов (T-Ag) .
Всего в классе 55 факторов.
