ТРАНСКРИПЦИОННЫЕ ФАКТОРЫ: КЛАСС: ТФ 4.4 домены типа бета-баррель/альфа-спираль
Класс факторов, содержащих бета-баррель/альфа-спирали
Оба известных представителя этого класса являются вирусными белками: фактор Е2 вируса папилломы быка ( BPV ) и фактор EBNA-1 вируса Эпштейна-Барра ( EBV ) [ Hegde R.S. et al., 1992 , Bochkarev A. et al., 1995 ]. В гомодимерных ДСД этих регуляторных белков восемь бета-нитей образуют бета-баррель, на поверхности которого располагаются две альфа-спирали. Эти альфа- спирали специфически связываются с ДНК по большой бороздке .
Фактор Е2 плавно изгибает ДНК вокруг структуры бета- барреля, что несколько напоминает ДНК-белковый комплекс, формируемый с участием фактора SRF , содержащего MADS-бокс , где ДНК также закручена вокруг белкового ядра. Показано, что он значим как для процесса транскрипции, так и репликации.
В этом случае критерием отнесения белка Е2 к рассматриваемому суперклассу является наличие только одного свойства: присутствие бета-барреля, на котором располагаются ДНК-связывающие элементы.
Относительно фактора EBNA-1 известно, что он связывается с районом начала репликации и стимулирует ее. Он предварительно отнесен к тому же классу транскрипционных факторов, что и E2.
