рРНК: Роль в терминации трансляции
Интересная мутация 16S рРНК , влияющая на узнавание терминирующего кодона UGA , была обнаружена Murgola с соавторами ( Murgola et al., 1988 ).
Делеция C 1054 создавала необычный кодон-специфичный суппрессор трансляции, считывающий кодоны UGA в двух из четырех позиций в гене trpA и в двух сайтах бактериофага Т4 . Вместе с тем, она не подавляла мутации амбер-кодона (UAG) , охра-кодона (UAA) или бессмысленных мутаций кодона UGA. Специфичность суппресии для UGA может объясняться потерей специфического РНК- РНК взаимодействия между кодоном UGA на матричной РНК и комплементарной последовательностью 16S рРНК. Тандемные триплеты 5'-UCA-3' (комплементарные 5'-UGA-3') существуют на 16S рРНК в позициях 1199-1204 в том же спаренном стебле, где расположен и нуклеотид C 1054. Триплеты 5'-UCA-3' и близлежащий "выступ" 1053-1054 являются консервативными чертами 16S рибосомных РНК.
Исключением из вышеуказанной закономерности является РНК Mycoplasma capricolum , содержащая последовательность 5'-CUACUA- 3' вместо последовательности 5'-UCAUCA-3'. Для этого организма кодон UGA не является терминирующим, а кодирует триптофан.
Для проверки модели кодон-специфического спаривания оснований между мРНК и рРНК Горингером были проведены эксперименты с сайт-направленным мутагенезом (C -> U) в тандемных триплетах UCA 1199 и 1202 E. coli ( Dahlberg, 1989 ). Оба полученные мутанта считывали кодон UGA, хотя и с меньшей эффективностью, чем мутанты с делецией 1054. Таким образом, предполагаемое спаривание оснований рибосомной РНК с терминирующим кодоном матричной РНК должно иметь место до вхождения UGA в А-сайт, в отличие от взаимодействия мРНК с последовательностью анти-SD , которая взаимодействует с кодонами после их считывания.
