Исследование микроцина C: новизна и научная значимость работы
Исследование регуляции экспрессии оперона микроцина C: новизна и научная значимость работы и задачи
Показано, что оперон mccABCDE E. coli транскрибируется с образованием моно- и полицистронного транскриптов. Короткий моноцистронный транскрипт содержит лишь открытую рамку считывания mccA , кодирующую пептид-предшественник микроцина С. Наличие этого транскрипта необходимо для эффективной продукции антибиотика.
Установлено, что образование короткого моноцистронного транскрипта регулируется уникальным механизмом трансляционной аттенюации, при котором терминация транскрипции происходит только при наличии сопряжения процессов транскрипции и трансляции гена mccA. Определены последовательности в некодирующем участке РНК между генами mccA и mccB , необходимые для осуществления такой аттенюации. Продемонстрировано, что механизм трансляционной аттенюации консервативен для ряда оперонов, гомологичных mcc оперону E. coli, найденных в геноме филогенетически далеких от E. coli бактерий.
Продемонстрирована ведущая роль белка MccF E. coli в защите клеток-продуцентов от внутриклеточного микроцина C на всех стадиях роста клеточной культуры. Изучена транскрипция генов mcc E. coli на разных стадиях роста клеточной культуры. Показано, что экспрессия mccF происходит конститутивно, то есть этот транскрипт детектируется на всех стадиях роста клеточной культуры, тогда как оперон mccABCDE начинает экспрессироваться лишь при переходе от экспоненциальной стадии роста к стационарной.
Проведен анализ транскриптов кластера генов mcc и определение их 5'-концов методом dRNAseq. Показано наличие ряда дополнительных внутренних промоторов кластера генов mcc, предположительно вносящих вклад в обеспечение устойчивости клеток к микроцину C на ранних стадиях роста клеточной культуры.
