Сигма фактор
Регуляция транскрипции генов возможна на каждой из стадий транскрипционного цикла. Прежде всего, интенсивность транскрипции гена определяется тем, насколько часто холофермент РНКП связывается с промотором и насколько быстро переходит от абортивной инициации к элонгации. Холофермент представляет собой комплекс кор-фермента, осуществляющего матричный синтез РНК, с сигма фактором, узнающим последовательность промотора [ Watson, 2004 ]. Сила промотора определяется его аффинностью к данному холоферменту, то есть близостью к консенсусной последовательности, узнаваемой данным сигма-фактором. У E. сoli, самый распространенный сигма-фактор сигма70 , ответственный за транскрипцию генов домашнего хозяйства, узнает промоторы, образованные двумя шестинуклеотидными последовательностями, районами -10 и -35 (названными так по характерному положению относительно старта транскрипции), разделенными спейсером в 14-17 п.о. Последовательности и расположение районов, узнаваемых альтернативными сигма-факторами, могут значительно отличаться. Инициация транскрипции может дополнительно модулироваться транскрипционными факторами, регуляторными ДНК-связывающими белками, ингибирующими (репрессоры) или стимулирующими (активаторы) связывание холофермента с промотором.
