Тандемные рибопереключатели

Трехгенный gcv оперон B. subtilis , кодирующий белки пути расщепления глицина, содержит в 5'-нетранслируемой области "включающий" глициновый рибопереключатель gcvT [ Mandal, 2004b ]. Большинство глициновых рибопереключателей расположены тандемами, что обеспечивает более быстрый ответ на изменение концентрации глицина благодаря кооперативности связывания лиганда. gcvT состоит из двух рядом расположенных глициновых аптамеров , типа I и типа II, разделенных небольшим линкером . Каждый из аптамеров способен связать одну молекулу глицина с одинаковой аффинностью , причем связывание первой молекулы облегчает связывание второй. Предполагается, что такая кооперативность позволяет клетке быстрее отвечать на небольшие колебания концентрации доступного глицина [ Mandal, 2004b ]. В описанной системе подряд расположены два одинаковых взаимозависимых рибопереключателя, однако возможны и другие типы тандемной регуляции с использованием разных и/или независимых сенсоров . Например, в 5'-области metE Bacillus clausii расположены два независимо действующих аптамера, SAM-узнающий S-бокс и B12 элемент , за каждым из которых расположен внутренний терминатор транскрипции, который формируется при связывании лиганда с аптамером. Таким образом повышение концентрации любого из лигандов приводит к остановке экспрессии гена metE [ Sudarsan, 2006 ], продукт которого осуществляет последнюю стадию синтеза метионина , в отсутствие B12 замещая B12-зависимый изофермент MetH [ Gonzаlez, 1992 ].

Ссылки: