Цели и задачи исследования регуляции экспрессии оперона микроцина C
Целью данной работы являтся выяснение регуляторных механизмов, обеспечивающих необходимые соотношения компонентов системы синтеза микроцина С и устойчивости к нему, а также характеристика их экспрессии на разных стадиях роста культуры клеток-продуцентов Escherichia coli . Для достижения этой цели были поставлены следующие задачи:
1. Определить механизм, обеспечивающий необходимое соотношение субстрата (пептида-предшественника MccA ) и модифицирующего его фермента ( аденилаттрансферазы MccB ) в клетках-продуцентах микроцина С.
2. Выяснить, действует ли подобный регуляторный механизм в гомологичных mcc E. coli оперонах бактерий, эволюционно не близких E. coli.
3. Исследовать влияние белков устойчивости к микроцину C на жизнеспособность клеток-продуцентов.
4. Охарактеризовать экспрессию генов mcc на разных стадиях роста культуры клеток-продуцентов.
5. Провести анализ транскриптов кластера генов mcc и определение их 5'-концов методом dRNAseq для исчерпывающего описания экспрессии генов mcc и картирования дополнительных промоторов, управляющих транскрипцией генов mcc.
